Las fosas sépticas constituyen una alternativa de bajo costo para el tratamiento de las aguas residuales generadas en zonas rurales y urbanas. La eficiencia en la remoción de contaminantes de un tanque séptico depende de las características del efluente y en particular del tamaño del tanque. El objetivo de este trabajo fue el desarrollo de una aplicación informática que calcula las dimensiones de un tanque séptico rectangular para servicio doméstico o público con un volumen máximo de 15 000 L. La aplicación FOSEP se construyó con lenguaje de programación Visual Basic v. 6.0 para el cálculo de las variables longitud (L), ancho (A), tirante menor (H1), tirante mayor (H2) y volumen total (Vt).  La herramienta FOSEP se aplicó a un caso de estudio para evaluar el diseño y funcionamiento de una fosa séptica que trata el agua residual doméstica generada por 60 usuarios de la comunidad “El Alberto” en el estado de Hidalgo. El análisis del diseño con la herramienta FOSEP mostró que la fosa séptica no cumple con las dimensiones recomendadas por esta aplicación, pero es eficiente en la remoción de DQO, SST, SSV y coliformes fecales.