En el presente trabajo se presenta un sistema sencillo para el estudio de cultivos en superficie, el cual consiste en tubos de ensayo con longitud, L= 18.5 cm y diámetro, D=3.3 cm. El sistema experimental fue evaluado con cultivos superficiales de Aspergillus niger que contenían 1.2 g de glucosa total pero con diferentes alturas de agar (H = 1.2, 2.3, 3.5 y 4.6 cm). Se midió el consumo de glucosa, y la producción de biomasa, ácido cítrico y bióxido de carbono, así como la altura del micelio. Los resultados muestran una correlación lineal positiva de la concentración inicial de sustrato (S0) con el flux promedio de glucosa (Js) y la tasa respiratoria, Rc. Sin embargo, el flux de biomasa (Jx) y ácido cítrico (JP) mostraron una correlación negativa con S0. Los resultados  indican que el destino del carbono consumido por los cultivos fúngicos superficiales depende de la magnitud del flux de sustrato que se le suministre al cultivo y, a su vez, el consumo del sustrato es controlado por la tasa de difusión del sustrato desde el medio a la superficie del cultivo. Estos resultados sugieren la necesidad de entender la importancia de Js, en el control del destino del carbono  en cultivos fúngicos superficiales.