La cinética de crecimiento de P. pastoris y los efectos tóxicos derivados de la presencia de metanol en el medio, fueron comparados en medio sólido (SSF) y medio líquido (SmF). Los cultivos SmF presentaron lisis moderada a las 72h sin metanol, comparados con la ausencia de lisis que se observó en los cultivos SSF. La presencia de metanol causó lisis en SmF y SSF, sin embargo, fue tres veces mayor este efecto en SmF. La biomasa máxima producida en SSF fue 52 g/L, en comparación con la obtenida en SmF, 42 g/L. Las observaciones microscópicas mostraron agregados celulares más pequeños en SmF comparados con los encontrados en SSF. Este es el primer trabajo donde se muestra un menor efecto de la autofagia celular en cultivos en espuma de poliuretano a bajas concentraciones de metanol comparados con los cultivos en matraz agitado. Estos resultados pueden explicarse en términos de comunicación célula a célula y en diferentes condiciones en la difusión en los agregados celulares. Este trabajo abre la posibilidad para utilizar espuma de poliuretano para cultivos SSF con el objetivo de producir proteínas recombinantes utilizando glicerol como fuente de carbono y metanol como inductor para la expresión.